Nukleiinihappo on suljettu eräänlaiseen säiliöön tai päällysteeseen, jota kutsutaan kapsidiksi ja joka koostuu proteiinin alayksiköiden, ns. kapsomeerit, joka puolestaan muodostuu toistamalla yksi, kaksi tai useampia proteiineja. Esimerkiksi papilloomaviruksessa kapsiidi koostuu useista kopioista kahdesta eri proteiinista, L1 ja L2; ensimmäisellä, runsaammalla, on kyky aggregoitua ja muodostaa nukleiinihappovapaita virioneja (se on hyvin immunogeeninen ja siksi sitä käytetään rokotteiden valmistuksen perustana).
The ydin takaa virukselle kyvyn suorittaa lisääntymis- ja kasvuprosesseja, kun taas kapsidi antaa muodon ja vakauden viruspartikkelille, suojaa sen genomia ja on tärkeä tarttuvuuden kannalta (reseptorivastaisten rakenteiden ansiosta).
Yhdessä kapsidi ja nukleiinihappo muodostavat nukleokapsidi.
Luonnossa on viruksia, jotka muodostuvat vain nukleiinihapoista ja kapsidista, ja tästä syystä niitä kutsutaan "paljaat virukset"; bakteriofagit ovat esimerkki paljaista viruksista. On myös muita viruspartikkeleita, jotka sisältävät kapsidin lisäksi uloimman kalvon, jota kutsutaan perikapsidiksi, peplos tai viitta (kirjekuori), joka on peräisin isäntäsolun plasmamembraanista ja koostuu sellaisenaan pääasiassa fosfolipideistä, mutta myös polysakkarideista ja proteiineista (yleensä glykoproteiineista). Viruksia, joilla on perikapsidi, kutsutaan "päällystetty viruksella"ja yleensä niillä on myös proteiinirakenne, jota kutsutaan matriisiksi tai integraatiksi, joka sijaitsee kapsidin ja perikapsidin välissä.
Päällystetyt virukset - perikapsidifosfolipidien ansiosta - tunkeutuvat helpommin herkkiin soluihin ja vähentävät isännän immuunivastetta; adenovirus, joka on vastuussa sidekalvotulehduksesta ja parainfluenssan oireista, on esimerkki päällystetystä viruksesta, kuten kaikki muutkin virukset, virukset, jotka tartuttavat eukaryootteja.
Viruksen kapsiidi voi normaalisti ottaa kaksi erilaista konformaatiota, jolle on tunnusomaista yksi ikosaedrinen rakenne tai kierteinen.
Ikososaedri on kiinteä, muodostuu tasasivuisista kolmioista, ja siinä on 12 kärkeä, 20 tasasivuisista kolmioista koostuvia pintoja ja 30 kolmioiden sivuja vastaavia reunoja, kun taas kärjet ovat sivujen kohtaamispaikkoja. Tämä kristallografinen rakenne perustuu liitto säätelee enemmän proteiinia; kutakin niistä kutsutaan monomeeriksi ja nämä monomeerit voivat liittyä viidestä viiteen muodostavaa pentonia tai - suuremmissa viruksissa - 6–6 muodostaen ns. eksoneja. Pentonien ja eksonien yhdistys muodostaa eikosaedrin, jonka sisältä löytyy geneettistä materiaalia.
Toisessa kapsidin rakenteellisessa typologiassa, jota kutsutaan kierteiseksi, yksittäiset monomeerit on järjestetty spiraaliksi akselin ympäri (proteiinit on järjestetty kierreportaiden portaiden tapaan) muodostaen onton sylinterin, joka sulkee nukleiinihapon.
Tobacco Mosaic -virus on tyypillinen esimerkki kierteisen rakenteen viruksesta, kun taas papilloomaviruksella on ikosaedrinen rakenne. On myös viruksia, joissa kapsidilla ei ole symmetriaa ja jolla on sekamorfologia (kuten HIV -virus, joka koostuu ikosaedrisesta kapsidista ja rihmamaisesta nukleiinihapon ytimestä).
Virusten luokittelu
Jokainen virus tunnistetaan lajin, suvun ja perheen mukaan. Jos esimerkiksi otamme HIV -viruksen, laji osoittaa mikrogranismin yleisen nimen, joka on hankittu immuunikatovirus tai tarkalleen HIV. Tämä virus kuuluu lentivirus -sukuun (eli hitaasti kasvavaan) ja retrovirusiin perhe (retrovirukset ovat viruksia, joilla on replikatiivinen sykli, jolle on tunnusomaista kaksi nukleiinihapon muotoa ja jotka esittävät käänteiskopioijaentsyymiksi kutsutun entsyymin, joka kykenee suorittamaan käänteiskopioinnin, joka muuntaa viruksen RNA: n DNA: ksi).
Kukin viruslaji kuvataan sitten rakenteen (nukleiinihapon koko, morfologia ja tyyppi), replikaatiotyypin (ydin- tai sytoplasminen), isäntäsolun (eläimet, sienet, kasvit tai bakteerit), kudoksen tropismin perusteella tai elin ja tartuntatyyppi (uloste-oraalinen, parenteraalinen jne.).
Antiviraaliset rokotteet
Antiviraaliset rokotteet voivat koostua tapetuista (inaktivoiduista), heikennetyistä viruksista (ne ovat säilyttäneet kykynsä replikoitua, mutta ovat menettäneet suuren osan patogeenisestä potentiaalistaan) tai viruksen alayksiköistä (uuden sukupolven rokotteet muodostetaan esimerkiksi virusperikapsidiproteiineista, Uuden sukupolven valmiste on hepatiitti B -rokote, joka perustuu yksinomaan HBV -viruksen kapsidiglykropeeniin.
Muut artikkelit aiheesta "Virusten rakenne ja luokittelu"
- Virus
- Virusten lisääntyminen
- Virusten ja viruslääkkeiden aiheuttamat sairaudet